El Puerto de Santander, junto con el Gobierno de Cantabria, el Ayuntamiento de Santander y otras diez instituciones de carácter económico, educativo y del conocimiento, ha suscrito un Pacto por la Innovación de Santander para acelerar el impulso en I+D+i en la capital cántabra que consolide a Santander como ciudad innovadora y emprendedora, y como Ciudad Inteligente. Para ello se apoya en cuatro objetivos fundamentales: potenciar y retener el talento, generando oportunidades para la innovación; fomentar el desarrollo de la innovación empresarial e institucional, aumentar el posicionamiento de Santander en el mapa internacional de la investigación e innovación, y potenciar su presencia en aquellos ámbitos económicos y sociales que hagan de Santander una ciudad inteligente.
Las instituciones firmantes de este Pacto promovido por el Ayuntamiento de Santander son, además del Gobierno regional y el Puerto, la Universidad de Cantabria, la Universidad Internacional Menéndez Pelayo, la Cámara de Comercio, CEOE, la Asociación Cántabra de la Empresa Familiar, la Asociación de Jóvenes Empresarios de Cantabria, la Asociación de Trabajadores Autónomos, la Asociación de Mujeres Empresarias y la Unión de Trabajadores Autónomos de Cantabria.